1. Napredna nano-cepiva na osnovi proteinskega origamija, ki kombinirajo aktivatorje prirojenega in pridobljenega imunskega odziva

ARRS projekt J3-7034 (nosilec dr. Mojca Benčina)

 Moderna cepiva, ki temeljijo na izoliranih antigenih, so varnejša, vendar pogosto le šibko imunogena. Imunski odziv teh cepiv se izboljša z dodatkom aktivatorjev prirojene imunosti. Imunogenost je najbolj učinkovita, ko so v istih antigen predstavitvenih celicah (APC) prisotni tako antigen, kot tudi agonisti Toll-u podobnih receptorjev (TLR). Predpostavljamo, da bo medsebojno povezovanje agonistov receptorjev TLR in antigenov preko polipeptidne matrike na osnovi obvitih vijačnic (ang. coiled coil, CC) pri t.i. naprednih nanocepivih, izboljšalo imunskia odziv, celično predstavitev antigenov ter tvorbo protiteles. Poleg tega bomo v projektu preučevali jakost in specifičnost imunskega odziva uravnavanega z različnimi kombinacijami agonistov TLR vezanih na CC-polipeptidne matrike. Medsebojno povezovanje imunološko aktivnih domen preko samo-sestavljivih struktur obvitih vijačnic bo zagotovilo celovitost nano-cepiv, hkrati pa bo omogočilo, da agonisti in antigeni skupaj vstopijo v iste celične strukture.

 

 

2. Medcelični prenos signalnega kompleksa z izvenceličnimi vezikli, ki se sproščajo iz celic, ki nosijo z WM-povezano mutacijo v MyD88

ARRS projekt J3-8196 (nosilec dr. Mateja Manček Keber)

V projektu predpostavljamo, da se signalni kompleks, ki vsebuje MyD88L265P lahko prenese iz aktiviranih celic preko zunajceličnih veziklov (extracellular vesicles - EVs; mikrovezikli in eksosomi) na druge celice, kjer lahko sprožijo aktivacijo vnetne poti ter tako pospešijo vnetje in inducirajo preživetveni signal. Ta mehanizem naj bi bil najbolj pomemben za B celične limfome, kjer se mutiran konstitutivno aktiven MyD88L265P pogosto pojavlja in je sposoben celične aktivacije brez ligandov TLR. Projekt želi potrditi sposobnost midosoma, ki se prenese z EV, da aktivira signaliziranje ter prisotnost tega procesa v človeških primarnih rakastih celicah. 

3. Pred zvite strukture DNA G-kvadrupleksov

(ARRS projekt J1-7108)

Naše raziskave bodo pripomogle k razširitvi in poglobitvi znanja o razumevanju različnih strukturnih lastnosti z gvanini bogatih DNA oligonukleotidnih zaporedij, ki izhajajo iz telomernih in promotorskih regij genov ljudi in drugih organizmov. Študije, ki potekajo v okviru projekta, pri katerih lahko strukturno, termodinamsko in kinetično ovrednotimo različna stanja predstavljajo pomemben korak pri načrtovanju novih potencialnih zdravil proti raku in protivirusnim obolenjem, ki bi se specifično vezala le na točno določeno strukturo in bi jo s tem (de)stabilizirala.

 

4. MaCChines – Molecular machines based on coiled-coil protein origami

Prof. dr. Roman Jerala je s petletnim projektom »MaCChines – Molecular machines based on coiled-coil protein origami« prejemnik ERC Advanced grant.

Cilj projekta je razviti princip priprave umetnih proteinov na osnovi modularnih obvitih vijačnic (CCPO) oz. ugotoviti kakšni so potenciali tega pristopa in kakšne tridimenzionalne strukture lahko naredimo na ta način. Gre za popolnoma nov tip načrtovanja proteinov, ki je modularen in se razlikuje od tistega na osnovi naravnih proteinov. Kot prvi na svetu smo ga razvili v skupini prof. Jerale. Kljub temu da gre za umetne proteine lahko takšne proteinske kletke pridobivamo v celicah brez škodljivih učinkov, kar jim daje velik potencial za medicinsko in tehnološko uporabo, za dostavo zdravil, za senzorje in nove materiale.

Pridobljeni projekt je prvi ERC projekt v Sloveniji s širšega področja ved o življenju in četrti ERC projekt za vodilne raziskovalce v Sloveniji.