NMR spektroskopija v raztopini

Večina zdravilnih učinkovin, ki so danes v klinični uporabi, so manjše organske molekule. Z NMR spektroskopijo jih znamo identificirati in karakterizirati. Pri kemijskih sintezah poleg želenih produktov, ki predstavljajo zdravilno učinkovino, nastanejo tudi stranski, neželeni produkti. Moderne NMR tehnike so postale eno izmed glavnih orodij za njihovo kvalitativno in kvantitativno določanje. NMR spektroskopija nam omogoča tudi študij interakcij med molekulami (npr. vezava majhne molekule na polimer), določevanje fleksibilnosti posameznih delov strukture, itd.

Z znanjem, ki ga imamo:

  • razvijamo in vpeljujemo nove metodologije in NMR tehnike za karakterizacijo spojin v raztopini,
  • izvajamo strukturne študije kompleksnih spojin v raztopini,
  • študiramo medmolekulske interakcije (npr. dokazovanje vodikovih vezi) in dinamična ravnotežja (npr. študij tavtomerij),
  • se ukvarjamo z določevanjem kristaliničnosti in amorfnosti trdnih vzorcev ter njihovih interakcij v trdnem in
  • določamo strukture nukleinskih kislin in njihovih interakcij v raztopini.

Vodja projekta:

  • dr. Primož Šket

Reference:

  • da Silva, M.W., Trajkovski, M., Sannohe, Y., Hessari, N.M., Sugiyama, H. and Plavec, J. (2009) Design of a G-quadruplex topology through glycosidic bond angles. Angew. Chem. Int. Edit., 48, 9167-9170.
  • Makuc, D., Triyanti, Albrecht, M., Plavec, J., Rissanen, K., Valkonen, A. and Schalley, C.A. (2009) The halide binding behavior of 2-carbamoyl-7-ureido-1H-indoles: Conformational aspects. Eur. J. Org. Chem., 4854-4866.
  • Makuc, D., Lenarcic, M., Bates, G.W., Gale, P.A. and Plavec, J. (2009) Anion-induced conformational changes in 2,7-disubstituted indole-based receptors. Org. Biomol. Chem., 7, 3505-3511.
  • Podbevsek, P., Sket, P. and Plavec, J. (2008) Stacking and not solely topology of T3 loops controls rigidity and ammonium ion movement within d(G4T3G4)2 G-quadruplex. J. Am. Chem. Soc., 130, 14287-14293.
  • Šket, P. and Plavec, J. (2007) Not all G-quadruplexes exhibit ion-channel-like properties: NMR study of ammonium ion (non)movement within the d(G3T4G4)2quadruplex. J. Am. Chem. Soc., 129, 8794-8800.