Dogodki

 
 
 
 

Center se delno financira

  

 
 
 

Pravni pouk

Pravni pouk

 
 
 

Karakterizacija bioloških makromolekul v raztopini

Raziskave fokusiramo na določevanje struktur in študije molekularne dinamike človeških proteinov in njihovih kompleksov s tarčnimi biomolekulami (peptidi, DNA/RNA) z vidika možnih aplikacij v medicini.

Z znanjem, ki ga imamo:

  • določamo tri-dimenzionalnih struktur proteinov,
  • preučujemo komplekse med proteini ter med proteini in peptidi,
  • analiziramo molekularne dinamike makromolekul s pomočjo podatkov o 15N relaksaciji,
  • vrednotimo strukturne razlike proteinov,
  • sintetiziramo in čistimo kratke RNK fragmente za strukturne študije kompleksov s človeškimi  prionskimi proteini.
 
 
 

dr. Igor Zhukov

dr. Igor Zhukov
 
 
 

Reference

  • Skerget, K., Taler-Vercic, A., Bavdek, A., Hodnik, V., Ceru, S., Tusek-Znidaric, M., Kumm, T., Pitsi, D., Pompe-Novak, M., Palumaa, P., Soriano, S., Kopitar-Jerala, N., Turk, V., Anderluh, G., and Zerovnik, E. (2010) “Interaction between oligomers of stefin B and amyloid-β in vitro and in cells”, J Biol Chem, 285, 3201-3210.
  • Brasun, J., Cebrat, M., Jaremko, L., Jaremko, M., Ilc, G., Gladysz, O., and Zhukov, I. (2009) “The structural effects of the Cys-S-S-Cys bridge exchange by the His-Cu(II)-His motif studied on natural peptides – a promising tool for natural compunds-based design”, Dalton Trans., 4853-4857.
  • Zhukov, I., Ejchart, A., and Bierzynski, A. (2008) “Structural and motional changes induced in apo-S100A1 protein by the disulfide formation between its Cys85 residue and β-mercaptoethanol”, Biochemistry, 47, 640-650.
  • Gozdek, A, Zhukov, I., Polkowska, A., Poznanski, J., Stankiewich-Drogon, A., Pawlowicz, J.M., Zagorski-Ostoja, W., Borowski, P., and Boguszewska-Chahulska, A.M. (2008) “NS3 peptide, a novel potent Hepatitis C virus NS3 helicase inhibitor: its mechanism of action and antiviral activity in the replicon system”, Antimicrob. Agents and Chemother., 52, 393-401.
  • Kazimierczuk, K., Zawardzka, A., Kozminski, W., and Zhukov, I. (2008) “Determination of spin-spin couplings from ultrahigh resolution 3D NMR spectra obtained by optimized random sampling and multidimensional Fourier transformation”, J. Am. Chem. Soc., 130, 5404-5405.
 
 
 

Publikacije

 
STRINJAM SE

Spletna stran uporablja piškotke za boljše delovanje

Z brskanjem po naši spletni strani se strinjate, da lahko uporabljamo piškotke, ki so namenjeni vaši boljši uporabniški izkušnji na naši spletni strani. Za lastne potrebe analitike uporabljamo Google Analytics, ki v ta namen namesti piškotke (izbriši GA piškotke). Več o piškotkih.