Center se delno financira

  

 
 
 

Pravni pouk

Pravni pouk

 
 
 

Določitev strukture DNK, ki jo tvori tandemsko zaporedje GGGAGCG

Določitev strukture DNK, ki jo tvori tandemsko zaporedje GGGAGCG

17.12.2014

Skupini raziskovalcev Centra odličnosti EN-FIST,NMR centra na Kemijskem inštitutu in Fakultete za kemijo in kemijsko tehnologijo Univerze v Ljubljani je uspelo določiti strukturo DNK, ki jo tvori tandemsko zaporedje GGGAGCG. To zaporedje najdemo v regulatorni regiji gena PLEKHG3, ki je povezan z avtizmom. Posebna zanimivost nove strukture iz štirih vijačnic je, da ni G-kvadrupleks, kljub temu, da je DNK zaporedje bogato z gvanini. To nepričakovano in zato odmevno odkritje je omogočilo, da so bili rezultati objavljeni v izredno ugledni reviji "Nature Communications" (Kocman in Plavec, 2014, doi:10.1038/ncomms6831). Neverjetno je, da smo po nekaj desetletjih študij struktur, ki jih tvorijo z gvanini bogata zaporedja odkrili strukturo, ki bi morala po vseh znanih in pričakovanih spoznanjih tvoriti G-kvadrupleks. V nasprotju s pričakovano strukturo, v kateri bi dva G-kvarteta kot sendvič vsebovala GCGC-kvartet, smo odkrili novo štirivijačno strukturo. Nova z gvanini bogata struktura ne samo razširja trenutni repertoar znanih struktur DNK, ampak omogoča temeljni razmislek, katere sile vodijo zvijanje oligonukleotidne DNK verige. Poglobljeno razumevanje energetike sil prepoznavanja preko vodikovih vezi nasproti energijam nalaganja heterocikličnih baz nukleotidnih ostankov bo pomagalo pri napredku znanosti. Hkrati pa nova struktura predstavlja opozorilo raziskovalcem, ki se poslužujejo predvsem bioinformatskih orodij, da samo na osnovi primerjav primarnih zaporedij polimernih molekul ne moremo sklepati na njihovo biološko vlogo in sorodnost. Za razumevanje biološke vloge je ključno poznavanje prostorskih struktur.

 Podrobnosti študije in članek so dostopni na spodnji povezavi:

http://www.nature.com/ncomms/2014/141215/ncomms6831/full/ncomms6831.html

 
 
 
STRINJAM SE

Spletna stran uporablja piškotke za boljše delovanje

Z brskanjem po naši spletni strani se strinjate, da lahko uporabljamo piškotke, ki so namenjeni vaši boljši uporabniški izkušnji na naši spletni strani. Za lastne potrebe analitike uporabljamo Google Analytics, ki v ta namen namesti piškotke (izbriši GA piškotke). Več o piškotkih.